怀孕后检查出孕酮值偏低，要根据实际情况来处理。由于孕酮值偏低容易出现先兆流产，因此对于孕囊发育良好的孕妇，可以在医生指导下补充黄体酮，及时进行保胎治疗，吃一些大豆类的食物，同时注意休息。如果胚胎发育异常或者胚胎停育，补充黄体酮的意义不大，建议到医院进行相应的处理。