早晨嗓子疼不建议注射新冠疫苗。早上嗓子疼可能是感冒或咽喉炎等引起，建议在治疗后再进行新冠疫苗的注射。当身体出现不适时建议推迟新冠疫苗的注射。在服药期间还是尽量避免注射新冠疫苗，因为任何药物都具有一定的副作用。避免加重炎症或影响药物疗效。有可能会影响病情恢复，还有可能会对疫苗效果产生影响，增加新冠疫苗不良反应发生机率。