细菌引起的腹泻和病毒引起的腹泻的区别主要在于大便的形状、气味以及大便常规检查等。细菌性腹泻的大便多为豆腐渣状，而病毒性腹泻的大便为蛋花汤状。当患者出现不明原因的腹泻以后，要及时前往医院进行检查，医生会根据患者的检查结果确诊病情，并且根据患者的情况选择药物进行治疗。