腹泻并且发烧39度的情况比较严重，可能是因为急性肠胃炎导致的，患者需要在医生的指导下使用退烧药物进行治疗。急性肠胃炎多是因为患者饮食不洁造成的，在发病以后，患者会出现腹痛、腹胀、腹泻等症状，还有可能伴随发热的出现，当出现急性肠胃炎时，患者可以在医生的指导下服用止泻消炎的药物进行治疗。